Naukowcy z UW opracowali nową metodę badania ważnych biologicznie struktur DNA

Zespół naukowców z Wydziału Fizyki Uniwersytetu Warszawskiego (UW) oraz Centrum Nowych Technologii UW, który tworzą: dr hab. Joanna Kowalska, dr Marcin Warmiński, dr. hab. Jacek Jemielity, prof. UW oraz Marek Baranowski, opublikował na łamach czasopisma naukowego "Nucleic Acids Research" (NAR) wyniki eksperymentów dotyczące syntezy i charakterystyki oligonukleotydów znakowanych atomem fluoru na jednym z końców nici kwasu nukleinowego (DNA) oraz ich zastosowań w badaniach metodą fluorowego jądrowego rezonansu magnetycznego (¹⁹F NMR).

Nowa metoda badania ważnych biologicznie struktur DNA

Opisane związki stanowią nowy rodzaj sond molekularnych do prostego wykrywania różnych wariantów przestrzennych DNA (tzw. struktur drugorzędowych), takich jak fragmenty dwuniciowe (dupleksy), a także bardziej nietypowe struktury – tzw. struktury niekanoniczne (G-kwadrupleksy i i-motywy). Znakowane fluorem fragmenty DNA umożliwiają badanie tych struktur za pomocą wrażliwej na zmiany strukturalne metody, jaką jest spektroskopia ¹⁹F NMR.

Artykuł naukowców z UW ze statusem "Breakthrough Paper" - artykułu przełomowego dla rozwoju nauki

Publikacja badaczy Uniwersytetu Warszawskiego otrzymała od recenzentów czasopisma "Nucleic Acids Research" status "Breakthrough Paper" - artykułu przełomowego dla rozwoju nauki.

Recenzenci docenili połączenie prostego i wydajnego podejścia syntetycznego, umożliwiającego otrzymanie fluorowanych cząsteczek DNA, z wykorzystaniem metody ¹⁹F NMR. Połączenie to zaowocowało opracowaniem metody badawczej o szerokim spektrum zastosowań: od śledzenia zmian strukturalnych dupleksów DNA do monitorowania oddziaływań pomiędzy kwasem nukleinowym a białkami i małymi cząsteczkami.

Rezultaty opisane w publikacji otwierają nowe możliwości w badaniach poznawczych kwasów nukleinowych, a także mogą znaleźć zastosowanie w odkrywaniu leków oddziałujących, poprzez specyficzne wiązanie, z określonymi sekwencjami lub strukturami przestrzennymi w DNA.

"Większość opracowywanych dotychczas leków działa poprzez oddziaływanie z białkami. Leki oddziałujące z DNA są natomiast mało selektywne, a przez to toksyczne. Opracowanie metod umożliwiających odkrywanie cząsteczek oddziałujących tylko z wybranymi sekwencjami DNA otwiera drogę do powstania leków charakteryzujących się znacznie mniejszą toksycznością" - powiedziała dr hab. Joanna Kowalska z Wydziału Fizyki UW, współautorka artykułu.

Tekst publikacji naukowców UW dostępny jest na stronie czasopisma "Nucleic Acids Research".